Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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CLDN19Q8N6F1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN19Q8N6F1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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