Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD4Q8N4Q1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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