Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS8Q8N3P4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms