Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms