Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APTXQ7Z2E3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APTXQ7Z2E3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms