Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSH2Q76I76 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSH2Q76I76 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms