Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP27Q6ZUM4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms