Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASCL4Q6XD76 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL4Q6XD76 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms