Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms