Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED9Q6R2W3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms