Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CSAG1Q6PB30 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms