Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD54Q6NXT1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms