Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms