Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms