Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI3KQ59H18 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms