Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SDK2Q58EX2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms