Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSD17B12Q53GQ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms