Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC39A12Q504Y0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC39A12Q504Y0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms