Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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