Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00303Q3SY05 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00303Q3SY05 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms