Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms