Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EDRF1Q3B7T1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EDRF1Q3B7T1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms