Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms