Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CA9Q16790 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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CA9Q16790 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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CA9Q16790 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CA9Q16790 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CA9Q16790 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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