Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms