Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FXNQ16595 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FXNQ16595 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FXNQ16595 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FXNQ16595 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FXNQ16595 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FXNQ16595 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FXNQ16595 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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FXNQ16595 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FXNQ16595 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FXNQ16595 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FXNQ16595 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FXNQ16595 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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