Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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