Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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