Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIX1Q15475 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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