Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK3Q15120 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms