Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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IRF5Q13568 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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