Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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