Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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