Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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