Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN3Q13286 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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