Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF5Q13243 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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