Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM32Q13049 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM32Q13049 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms