Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms