Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN1Q04323 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms