Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms