Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTCQ00610 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms