Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms