Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA3P52797 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms