Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms