Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIA2P42262 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms