Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE6BP35913 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms