Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPB2P35606 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPB2P35606 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPB2P35606 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPB2P35606 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPB2P35606 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms