Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG3P32926 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG3P32926 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG3P32926 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms