Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLIP1P30622 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms