Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXP28300 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LOXP28300 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LOXP28300 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LOXP28300 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LOXP28300 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LOXP28300 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LOXP28300 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LOXP28300 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LOXP28300 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXP28300 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms